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Table 4 Consensus amplification RCNAs in 6 studies

From: Copy number alterations detected by whole-exome and whole-genome sequencing of esophageal adenocarcinoma

Cytoband

Boundary (Mb)

D

F

P

B

Z

O

3q26.2

chr3:167.60-170.90

Y

Y

  

Y

Y

6p21.1

chr6:40.50-46.20

Y

Y

  

Y

Y

6q23.3

chr6:135.20-139.00

Y

   

Y

Y

7p11.2

chr7:54.00-58.00

Y

Y

Y

Y

Y

Y

7q21.2

chr7:91.10-92.80

Y

Y

Y

 

Y

Y

7q21.3

chr7:92.80-98.00

 

Y

Y

Y

  

7q22.1

chr7:98.00-103.80

Y

 

Y

Y

 

Y

8p23.1

chr8:6.20-12.70

Y

Y

  

Y

Y

8q24.13

chr8:122.50-127.30

  

Y

Y

 

Y

8q24.21

chr8:127.30-131.50

Y

Y

Y

Y

Y

Y

9p13.3

chr9:33.20-36.30

Y

   

Y

Y

11q13.3

chr11:68.40-70.40

Y

Y

 

Y

Y

Y

12p12.1

chr12:21.30-26.50

Y

Y

 

Y

Y

Y

12q14.3

chr12:65.10-67.70

Y

  

Y

 

Y

12q15

chr12:67.70-71.50

Y

Y

 

Y

Y

Y

13q22.1

chr13:73.30-75.40

 

Y

 

Y

Y

Y

15q26.1

chr15:89.10-94.30

  

Y

 

Y

Y

15q26.2

chr15:94.30-98.50

 

Y

Y

 

Y

 

17q12

chr17:31.80-38.10

Y

Y

Y

Y

Y

Y

18q 11.2

chr18:19.00-25.00

Y

Y

Y

 

Y

Y

19q12

chr19:28.60-32.40

Y

Y

Y

Y

Y

Y

20q13.2

chr20:49.80-55.00

 

Y

Y

  

Y

  1. These regions are those that appear in at least three studies
  2. D Dulak et al. 2012 [14], F Frankel et al. 2014 [16], P Paulson et al. 2009 [13], B Beroukhim et al. 2010 [3], Z Zack et al. 2013 [4], O our study, Y indicates a region was identified in a study