Skip to main content

Table 8 The expected accuracy results of the missense mutations of epidermal and hyperproliferative keratins in moderate psoriasis predicted as deleterious in PredictSNP and integrated tool

From: Mutational analysis of epidermal and hyperproliferative type I keratins in mild and moderate psoriasis vulgaris patients: a possible role in the pathogenesis of psoriasis along with disease severity

Gene CDS mutation AA mutation Predict SNP MAPP PhD-SNP PolyPhen-1 PolyPhen-2 SIFT SNAP PANTHER
Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy
K14 c.388C > G p.L130V DEL 0.76 DEL 0.72 DEL 0.86 DEL 0.74 DEL 0.65 DEL 0.79 NEU 0.58 DEL 0.77
c.415G > C p.A139P DEL 0.87 DEL 0.59 DEL 0.82 DEL 0.74 DEL 0.65 DEL 0.53 DEL 0.56 DEL 0.74
c.419A > T p.N140I DEL 0.87 DEL 0.84 DEL 0.86 DEL 0.74 DEL 0.81 DEL 0.79 DEL 0.62 DEL 0.87
c.442C > T p.R148C DEL 0.76 DEL 0.59 DEL 0.88 DEL 0.74 DEL 0.68 DEL 0.79 NEU 0.55 DEL 0.87
c.512A > T p.D171V DEL 0.76 DEL 0.59 DEL 0.82 DEL 0.74 DEL 0.56 DEL 0.79 NEU 0.50 DEL 0.74
c.519G > T p.R173S DEL 0.76 DEL 0.59 DEL 0.61 DEL 0.59 DEL 0.43 DEL 0.79 NEU 0.50 DEL 0.74
c.904G > C p.A302P DEL 0.61 DEL 0.75 DEL 0.82 DEL 0.59 NEU 0.64 DEL 0.79 NEU 0.50 DEL 0.84
c.1057G > C p.A353P DEL 0.61 DEL 0.57 DEL 0.86 DEL 0.74 DEL 0.47 NEU 0.74 NEU 0.61 DEL 0.68
c.1234A > T P.I412F DEL 0.87 DEL 0.63 DEL 0.77 DEL 0.74 DEL 0.81 DEL 0.79 DEL 0.56 – 0.00
K10 c.479A > C p.Y160S DEL 0.87 DEL 0.86 DEL 0.86 DEL 0.74 DEL 0.81 DEL 0.79 DEL 0.72 – 0.00
c.520C > A p.L174M DEL 0.76 DEL 0.72 DEL 0.59 DEL 0.74 DEL 0.65 DEL 0.79 NEU 0.55 DEL 0.72
c.674A > C p.D225A DEL 0.87 DEL 0.66 DEL 0.68 DEL 0.74 DEL 0.68 DEL 0.79 DEL 0.56 DEL 0.77
c.704G > T p.R235M DEL 0.76 DEL 0.59 DEL 0.82 DEL 0.74 DEL 0.81 DEL 0.79 NEU 0.55 DEL 0.78
c.711G > T p.K237N DEL 0.76 DEL 0.75 DEL 0.88 DEL 0.59 DEL 0.63 DEL 0.79 NEU 0.50 DEL 0.74
c.785T > A p.L262Q DEL 0.76 DEL 0.41 DEL 0.61 DEL 0.74 DEL 0.81 DEL 0.79 NEU 0.50 DEL 0.78
K16 c.410C > T p.A137V NEU 0.63 NEU 0.70 NEU 0.45 DEL 0.59 NEU 0.61 DEL 0.79 NEU 0.71 DEL 0.68
c.583G > T p.A195S NEU 0.65 NEU 0.66 NEU 0.51 NEU 0.67 DEL 0.47 DEL 0.45 NEU 0.71 DEL 0.72
c.589C > A p.L197M NEU 0.60 NEU 0.79 DEL 0.59 NEU 0.67 DEL 0.59 DEL 0.45 NEU 0.83 DEL 0.67
c.634C > G p.L212V NEU 0.60 DEL 0.51 NEU 0.51 NEU 0.67 DEL 0.45 DEL 0.53 NEU 0.77 DEL 0.71
c.667C > G p.L223V DEL 0.76 DEL 0.75 DEL 0.77 DEL 0.74 DEL 0.65 DEL 0.79 NEU 0.55 DEL 0.71
K17 c.503A > T p.D168V DEL 0.87 DEL 0.63 DEL 0.82 DEL 0.59 DEL 0.68 DEL 0.79 DEL 0.56 DEL 0.87
c.662A > T p.N221I DEL 0.72 NEU 0.77 DEL 0.59 DEL 0.74 DEL 0.81 DEL 0.79 DEL 0.56 DEL 0.74
c.682G > C p.A228P DEL 0.72 DEL 0.48 DEL 0.88 DEL 0.74 DEL 0.50 DEL 0.46 NEU 0.61 DEL 0.73
c.907C > T p.L303F DEL 0.51 NEU 0.75 NEU 0.51 DEL 0.74 DEL 0.65 DEL 0.79 NEU 0.50 DEL 0.78
c.986C > T p.A329V DEL 0.55 DEL 0.48 DEL 0.77 NEU 0.67 DEL 0.40 DEL 0.46 NEU 0.61 DEL 0.72
c.1070G > T p.R357L DEL 0.72 DEL 0.77 DEL 0.68 DEL 0.59 NEU 0.68 DEL 0.79 DEL 0.56 DEL 0.76
c.1144G > T p.A382S NEU 0.83 NEU 0.64 NEU 0.51 NEU 0.67 NEU 0.70 NEU 0.71 NEU 0.71 DEL 0.57
c.1210A > C p.T404P NEU 0.63 DEL 0.51 DEL 0.68 NEU 0.67 NEU 0.71 NEU 0.65 NEU 0.50 NEU 0.48
  1. DEL deleterious, NEU neutral
Back to article page

Human Genomics

ISSN: 1479-7364