Skip to main content

Table 3 Correlation analysis between CDK1, HMMR, PTTG1, and TTK and related immune markers in immune cells, as evaluated using TIMER

From: Identification of hub genes associated with prognosis, diagnosis, immune infiltration and therapeutic drug in liver cancer by integrated analysis

Description

Gene marker

CDK1

HMMR

PTTG1

TTK

Cor

P

Cor

P

Cor

P

Cor

P

CD8+ T cell

CD8A

0.198

***

0.139

**

0.164

**

0.188

***

CD8B

0.184

***

0.096

0.064

0.226

***

0.165

**

T cell (general)

CD3D

0.274

***

0.154

**

0.333

***

0.266

***

CD3E

0.202

***

0.120

*

0.175

***

0.195

***

CD2

0.216

***

0.121

*

0.204

***

0.204

***

B cell

CD19

0.273

***

0.204

***

0.247

***

0.273

***

CD79A

0.158

**

0.065

0.212

0.116

*

0.177

***

Monocyte

CD86

0.284

***

0.266

***

0.250

***

0.283

***

CD115

0.131

*

0.138

**

0.102

*

0.119

*

TAM

CCL2

0.039

0.459

0.023

0.656

− 0.023

0.665

0.021

0.682

CD68

0.230

***

0.186

***

0.149

*

0.204

***

IL10

0.219

***

0.223

***

0.156

*

0.235

***

M1 macrophage

NOS2

− 0.020

0.695

0.080

0.123

− 0.140

**

− 0.005

0.926

IRF5

0.394

***

0.407

***

0.291

***

0.373

***

COX2

0.101

0.053

0.071

0.171

− 0.025

0.637

0.094

0.070

M2 Macrophage

CD163

0.067

0.197

0.153

**

− 0.022

0.676

0.073

0.160

VSIG4

0.080

0.123

0.138

**

0.024

0.647

0.059

0.255

MS4A4A

0.089

0.086

0.142

**

0.027

0.601

0.079

0.128

Neutrophils

CD66b

0.123

*

0.096

0.066

0.094

0.071

0.107

*

CD11b

0.257

***

0.333

***

0.237

***

0.280

***

CCR7

0.089

0.086

0.045

0.385

− 0.030

0.569

0.070

0.181

Natural killer cell

KIR3DL1

0.010

0.843

0.068

0.189

− 0.053

0.308

0.009

0.869

KIR2DL1

− 0.035

0.500

− 0.023

0.656

− 0.068

0.190

− 0.044

0.393

KIR2DS4

0.075

0.148

0.076

0.142

0.029

0.581

0.044

0.400

Dendritic cell

CD11C

0.331

***

0.310

***

0.246

***

0.326

***

CD1C

0.121

*

0.066

0.204

0.041

0.434

0.104

*

NRP1

0.231

***

0.195

***

0.005

0.916

0.180

***

PDL1

CD274

0.209

***

0.334

***

0.062

0.230

0.062

0.230

Th l

STAT4

0.262

***

0.179

***

0.215

***

0.246

***

STAT1

0.372

***

0.372

***

0.248

***

0.398

***

TBX21

0.081

0.119

0.050

0.341

0.018

0.736

0.084

0.107

CD4

0.222

***

0.232

***

0.123

*

0.228

***

IFNG

0.266

***

0.219

***

0.285

***

0.275

***

Th 2

GATA3

0.203

***

0.135

**

0.133

*

0.185

***

STAT6

0.114

*

0.192

***

− 0.108

*

0.115

*

CXCR4

0.315

***

0.224

***

0.204

***

0.292

***

CCR4

0.206

***

0.220

***

− 0.023

0.663

0.213

***

Treg

FOXP3

0.163

**

0.271

***

0.023

0.655

0.205

***

CCR8

0.392

***

0.418

***

0.209

***

0.403

***

STAT5B

0.247

***

0.355

***

− 0.022

0.676

0.278

***

TGFB1

0.278

***

0.174

***

0.207

***

0.253

***

T cell exhaustion

PD-1

0.330

***

0.196

***

0.333

***

0.308

***

CTLA4

0.357

***

0.244

***

0.384

***

0.348

***

LAG3

0.294

***

0.205

***

0.348

***

0.318

***

TIM-3

0.296

***

0.281

***

0.272

***

0.289

***

GZMB

0.092

0.078

0.048

0.355

0.123

*

0.065

0.212

  1. *P < 0.05; **P < 0.01; ***P < 0.0001