Identification of a novel signature based on unfolded protein response-related gene for predicting prognosis in bladder cancer

Zhu, Ke; Xiaoqiang, Liu; Deng, Wen; Wang, Gongxian; Fu, Bin

doi:10.1186/s40246-021-00372-x

Human Genomics

Table 1 The correlation between seven UPR genes and immune cell markers

From: Identification of a novel signature based on unfolded protein response-related gene for predicting prognosis in bladder cancer

Description	Gene markers	CRYAB		CALR		DNAJB4		HSPB6		KDELR3		FBXO6		CREB3L3
		GEPIA
		R	P	R	P	R	P	R	P	R	P	R	P	R	P
B cell	CD19	0.41	***	0.12	*	0.13	**	0.46	***	0.27	***	0.24	***	0.15	**
	CD79A	0.42	***	0.056	ns	0.14	**	0.46	***	0.25	***	0.18	***	0.11	*
	MS4A1	0.36	***	− 0.018	ns	0.17	***	0.46	***	0.19	***	0.13	*	0.16	**
CD8⁺ T cell	CD8A	0.28	***	0.24	***	0.3	***	0.18	***	0.18	***	0.46	***	0.1	*
	CD8B	0.23	***	0.27	***	0.25	***	0.19	***	0.16	**	0.39	***	0.08	ns
	IL2RA	0.45	***	0.31	***	0.41	***	0.32	***	0.3	***	0.38	***	0.12	*
M1 macrophages	PTGS2	0.16	**	0.11	*	0.34	***	0.12	*	0.22	***	0.13	*	0.072	ns
M1 macrophages	NOS2	0.12	*	− 0.081	ns	0.1	*	0.26	***	0.11	*	0.14	**	0.13	**
M2 macrophages	CD163	0.54	***	0.36	***	0.35	***	0.44	***	0.42	***	0.34	***	0.094	ns
	CD209	0.52	***	0.29	***	0.43	***	0.39	***	0.33	***	0.31	***	0.085	ns
	MRC1	0.51	***	0.28	***	0.39	***	0.4	***	0.39	***	0.29	***	0.11	*
M0 macrophages	CD14	0.56	***	0.35	***	0.38	***	0.39	***	0.31	***	0.33	***	0.057	ns
	CD33	0.53	***	0.31	***	0.34	***	0.45	***	0.33	***	0.29	***	0.11	*
	ITGAX	0.53	***	0.26	***	0.41	***	0.41	***	0.36	***	0.34	***	0.12	*
TAM	CCL2	0.54	***	0.23	***	0.34	***	0.52	***	0.41	***	0.27	***	0.14	**
	CD68	0.31	***	0.29	***	0.44	***	0.14	**	0.11	*	0.37	***	0.0091	ns
	CD86	0.5	***	0.31	***	0.45	***	0.32	***	0.26	***	0.38	***	0.083	ns
Neutrophil	CD55	0.13	**	0.014	ns	0.21	***	0.14	**	0.34	***	0.016	ns	0.07	ns
	FCGR3A	0.49	***	0.37	***	0.4	***	0.34	***	0.39	***	0.39	***	0.094	ns
	ITGAM	0.5	***	0.33	***	0.43	***	0.39	***	0.37	***	0.35	***	0.15	**
Natural killer cell	CD7	0.35	***	0.27	***	0.29	***	0.24	***	0.19	***	0.47	***	0.082	ns
Natural killer cell	KIR3DL1	0.19	***	0.16	**	0.19	***	0.14	**	0.14	**	0.33	***	0.11	*
Dendritic cell	CD1C	0.37	***	0.0072	ns	0.26	***	0.36	***	0.0078	ns	0.018	ns	0.048	ns
Dendritic cell	THBD	0.25	***	0.057	ns	0.32	***	0.048	ns	− 0.038	ns	0.16	**	− 0.17	***
T cell exhaustion	CTLA4	0.36	***	0.26	***	0.31	***	0.2	***	0.19	***	0.43	***	0.12	*
	LAG3	0.31	***	0.36	***	0.28	***	0.15	**	0.21	***	0.47	***	0.12	*
	PD-1	0.32	***	0.27	***	0.29	***	0.23	***	0.21	***	0.48	***	15	**
Treg	FOXP3	0.39	***	0.24	***	0.38	***	0.29	***	0.23	***	0.39	***	0.14	**
	IL7R	0.51	***	0.27	***	0.42	***	0.35	***	0.35	***	0.3	***	0.075	ns
	NT5E	0.4	***	0.25	***	0.39	***	0.18	***	0.27	***	0.16	**	− 0.024	ns
Th1 cell	CCR1	0.4	***	0.36	***	0.36	***	0.32	***	0.41	***	0.34	***	0.12	*
	CCR5	0.37	***	0.3	***	0.35	***	0.28	***	0.29	***	0.43	***	0.15	**
	IL12RB1	0.37	***	0.28	***	0.34	***	0.25	***	0.22	***	0.46	***	0.11	*
Th2 cell	CCR4	0.35	***	0.081	ns	0.38	***	0.39	***	0.25	***	0.26	***	0.17	***
Th2 cell	CCR8	0.34	***	0.14	**	0.46	***	0.25	***	0.28	***	0.31	***	0.18	***

***P < 0.001, **P < 0.01, *P < 0.05, ns

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ISSN: 1479-7364

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