Human genome meeting 2016

Srivastava, A. K.; Wang, Y.; Huang, R.; Skinner, C.; Thompson, T.; Pollard, L.; Wood, T.; Luo, F.; Stevenson, R.; Polimanti, R.; Gelernter, J.; Lin, X.; Lim, I. Y.; Wu, Y.; Teh, A. L.; Chen, L.; Aris, I. M.; Soh, S. E.; Tint, M. T.; MacIsaac, J. L.; Yap, F.; Kwek, K.; Saw, S. M.; Kobor, M. S.; Meaney, M. J.; Godfrey, K. M.; Chong, Y. S.; Holbrook, J. D.; Lee, Y. S.; Gluckman, P. D.; Karnani, N.; Kapoor, A.; Lee, D.; Chakravarti, A.; Maercker, C.; Graf, F.; Boutros, M.; Stamoulis, G.; Santoni, F.; Makrythanasis, P.; Letourneau, A.; Guipponi, M.; Panousis, N.; Garieri, M.; Ribaux, P.; Falconnet, E.; Borel, C.; Antonarakis, S. E.; Kumar, S.; Curran, J.; Blangero, J.; Chatterjee, S.; Kapoor, A.; Akiyama, J.; Auer, D.; Berrios, C.; Pennacchio, L.; Chakravarti, A.; Donti, T. R.; Cappuccio, G.; Miller, M.; Atwal, P.; Kennedy, A.; Cardon, A.; Bacino, C.; Emrick, L.; Hertecant, J.; Baumer, F.; Porter, B.; Bainbridge, M.; Bonnen, P.; Graham, B.; Sutton, R.; Sun, Q.; Elsea, S.; Hu, Z.; Wang, P.; Zhu, Y.; Zhao, J.; Xiong, M.; Bennett, David A.; Hidalgo-Miranda, A.; Romero-Cordoba, S.; Rodriguez-Cuevas, S.; Rebollar-Vega, R.; Tagliabue, E.; Iorio, M.; D’Ippolito, E.; Baroni, S.; Kaczkowski, B.; Tanaka, Y.; Kawaji, H.; Sandelin, A.; Andersson, R.; Itoh, M.; Lassmann, T.; Hayashizaki, Y.; Carninci, P.; Forrest, A. R. R.; Semple, C. A.; Rosenthal, E. A.; Shirts, B.; Amendola, L.; Gallego, C.; Horike-Pyne, M.; Burt, A.; Robertson, P.; Beyers, P.; Nefcy, C.; Veenstra, D.; Hisama, F.; Bennett, R.; Dorschner, M.; Nickerson, D.; Smith, J.; Patterson, K.; Crosslin, D.; Nassir, R.; Zubair, N.; Harrison, T.; Peters, U.; Jarvik, G.; Menghi, F.; Inaki, K.; Woo, X.; Kumar, P.; Grzeda, K.; Malhotra, A.; Kim, H.; Ucar, D.; Shreckengast, P.; Karuturi, K.; Keck, J.; Chuang, J.; Liu, E. T.; Ji, B.; Tyler, A.; Ananda, G.; Carter, G.; Nikbakht, H.; Montagne, M.; Zeinieh, M.; Harutyunyan, A.; Mcconechy, M.; Jabado, N.; Lavigne, P.; Majewski, J.; Goldstein, J. B.; Overman, M.; Varadhachary, G.; Shroff, R.; Wolff, R.; Javle, M.; Futreal, A.; Fogelman, D.; Bravo, L.; Fajardo, W.; Gomez, H.; Castaneda, C.; Rolfo, C.; Pinto, J. A.; Akdemir, K. C.; Chin, L.; Futreal, A.; Patterson, S.; Statz, C.; Mockus, S.; Nikolaev, S. N.; Bonilla, X. I.; Parmentier, L.; King, B.; Bezrukov, F.; Kaya, G.; Zoete, V.; Seplyarskiy, V.; Sharpe, H.; McKee, T.; Letourneau, A.; Ribaux, P.; Popadin, K.; Basset-Seguin, N.; Chaabene, R. Ben; Santoni, F.; Andrianova, M.; Guipponi, M.; Garieri, M.; Verdan, C.; Grosdemange, K.; Sumara, O.; Eilers, M.; Aifantis, I.; Michielin, O.; de Sauvage, F.; Antonarakis, S.; Likhitrattanapisal, S.; Lincoln, S.; Kurian, A.; Desmond, A.; Yang, S.; Kobayashi, Y.; Ford, J.; Ellisen, L.; Peters, T. L.; Alvarez, K. R.; Hollingsworth, E. F.; Lopez-Terrada, D. H.; Hastie, A.; Dzakula, Z.; Pang, A. W.; Lam, E. T.; Anantharaman, T.; Saghbini, M.; Cao, H.; Gonzaga-Jauregui, C.; Ma, L.; King, A.; Rosenzweig, E. Berman; Krishnan, U.; Reid, J. G.; Overton, J. D.; Dewey, F.; Chung, W. K.; Small, K.; DeLuca, A.; Cremers, F.; Lewis, R. A.; Puech, V.; Bakall, B.; Silva-Garcia, R.; Rohrschneider, K.; Leys, M.; Shaya, F. S.; Stone, E.; Sobreira, N. L.; Schiettecatte, F.; Ling, H.; Pugh, E.; Witmer, D.; Hetrick, K.; Zhang, P.; Doheny, K.; Valle, D.; Hamosh, A.; Jhangiani, S. N.; Akdemir, Z. Coban; Bainbridge, M. N.; Charng, W.; Wiszniewski, W.; Gambin, T.; Karaca, E.; Bayram, Y.; Eldomery, M. K.; Posey, J.; Doddapaneni, H.; Hu, J.; Sutton, V. R.; Muzny, D. M.; Boerwinkle, E. A.; Valle, D.; Lupski, J. R.; Gibbs, R. A.; Shekar, S.; Salerno, W.; English, A.; Mangubat, A.; Bruestle, J.; Thorogood, A.; Knoppers, B. M.; Takahashi, H.; Nitta, K. R.; Kozhuharova, A.; Suzuki, A. M.; Sharma, H.; Cotella, D.; Santoro, C.; Zucchelli, S.; Gustincich, S.; Carninci, P.; Mulvihill, J. J.; Baynam, G.; Gahl, W.; Groft, S. C.; Kosaki, K.; Lasko, P.; Melegh, B.; Taruscio, D.; Ghosh, R.; Plon, S.; Scherer, S.; Qin, X.; Sanghvi, R.; Walker, K.; Chiang, T.; Muzny, D.; Wang, L.; Black, J.; Boerwinkle, E.; Weinshilboum, R.; Gibbs, R.; Karpinets, T.; Calderone, T.; Wani, K.; Yu, X.; Creasy, C.; Haymaker, C.; Forget, M.; Nanda, V.; Roszik, J.; Wargo, J.; Haydu, L.; Song, X.; Lazar, A.; Gershenwald, J.; Davies, M.; Bernatchez, C.; Zhang, J.; Futreal, A.; Woodman, S.; Chesler, E. J.; Reynolds, T.; Bubier, J. A.; Phillips, C.; Langston, M. A.; Baker, E. J.; Xiong, M.; Ma, L.; Lin, N.; Amos, C.; Lin, N.; Wang, P.; Zhu, Y.; Zhao, J.; Calhoun, V.; Xiong, M.; Dobretsberger, O.; Egger, M.; Leimgruber, F.; Sadedin, S.; Oshlack, A.; Antonio, V. A. A.; Ono, N.; Ahmed, Z.; Bolisetty, M.; Zeeshan, S.; Anguiano, E.; Ucar, D.; Sarkar, A.; Nandineni, M. R.; Zeng, C.; Shao, J.; Cao, H.; Hastie, A.; Pang, A. W.; Lam, E. T.; Liang, T.; Pham, K.; Saghbini, M.; Dzakula, Z.; Chee-Wei, Y.; Dongsheng, L.; Lai-Ping, W.; Lian, D.; Hee, R. O. Twee; Yunus, Y.; Aghakhanian, F.; Mokhtar, S. S.; Lok-Yung, C. V.; Bhak, J.; Phipps, M.; Shuhua, X.; Yik-Ying, T.; Kumar, V.; Boon-Peng, H.; Campbell, I.; Young, M. -A.; James, P.; Rain, M.; Mohammad, G.; Kukreti, R.; Pasha, Q.; Akilzhanova, A. R.; Guelly, C.; Abilova, Z.; Rakhimova, S.; Akhmetova, A.; Kairov, U.; Trajanoski, S.; Zhumadilov, Z.; Bekbossynova, M.; Schumacher, C.; Sandhu, S.; Harkins, T.; Makarov, V.; Doddapaneni, H.; Glenn, R.; Momin, Z.; Dilrukshi, B.; Chao, H.; Meng, Q.; Gudenkauf, B.; Kshitij, R.; Jayaseelan, J.; Nessner, C.; Lee, S.; Blankenberg, K.; Lewis, L.; Hu, J.; Han, Y.; Dinh, H.; Jireh, S.; Walker, K.; Boerwinkle, E.; Muzny, D.; Gibbs, R.; Hu, J.; Walker, K.; Buhay, C.; Liu, X.; Wang, Q.; Sanghvi, R.; Doddapaneni, H.; Ding, Y.; Veeraraghavan, N.; Yang, Y.; Boerwinkle, E.; Beaudet, A. L.; Eng, C. M.; Muzny, D. M.; Gibbs, R. A.; Worley, K. C. C.; Liu, Y.; Hughes, D. S. T.; Murali, S. C.; Harris, R. A.; English, A. C.; Qin, X.; Hampton, O. A.; Larsen, P.; Beck, C.; Han, Y.; Wang, M.; Doddapaneni, H.; Kovar, C. L.; Salerno, W. J.; Yoder, A.; Richards, S.; Rogers, J.; Lupski, J. R.; Muzny, D. M.; Gibbs, R. A.; Meng, Q.; Bainbridge, M.; Wang, M.; Doddapaneni, H.; Han, Y.; Muzny, D.; Gibbs, R.; Harris, R. A.; Raveenedran, M.; Xue, C.; Dahdouli, M.; Cox, L.; Fan, G.; Ferguson, B.; Hovarth, J.; Johnson, Z.; Kanthaswamy, S.; Kubisch, M.; Platt, M.; Smith, D.; Vallender, E.; Wiseman, R.; Liu, X.; Below, J.; Muzny, D.; Gibbs, R.; Yu, F.; Rogers, J.; Lin, J.; Zhang, Y.; Ouyang, Z.; Moore, A.; Wang, Z.; Hofmann, J.; Purdue, M.; Stolzenberg-Solomon, R.; Weinstein, S.; Albanes, D.; Liu, C. S.; Cheng, W. L.; Lin, T. T.; Lan, Q.; Rothman, N.; Berndt, S.; Chen, E. S.; Bahrami, H.; Khoshzaban, A.; Keshal, S. Heidari; Bahrami, H.; Khoshzaban, A.; Keshal, S. Heidari; Alharbi, K. K. R.; Zhalbinova, M.; Akilzhanova, A.; Rakhimova, S.; Bekbosynova, M.; Myrzakhmetova, S.; Matar, M.; Mili, N.; Molinari, R.; Ma, Y.; Guerrier, S.; Elhawary, N.; Tayeb, M.; Bogari, N.; Qotb, N.; McClymont, S. A.; Hook, P. W.; Goff, L. A.; McCallion, A.; Kong, Y.; Charette, J. R.; Hicks, W. L.; Naggert, J. K.; Zhao, L.; Nishina, P. M.; Edrees, B. M.; Athar, M.; Al-Allaf, F. A.; Taher, M. M.; Khan, W.; Bouazzaoui, A.; Harbi, N. A.; Safar, R.; Al-Edressi, H.; Anazi, A.; Altayeb, N.; Ahmed, M. A.; Alansary, K.; Abduljaleel, Z.; Kratz, A.; Beguin, P.; Poulain, S.; Kaneko, M.; Takahiko, C.; Matsunaga, A.; Kato, S.; Suzuki, A. M.; Bertin, N.; Lassmann, T.; Vigot, R.; Carninci, P.; Plessy, C.; Launey, T.; Graur, D.; Lee, D.; Kapoor, A.; Chakravarti, A.; Friis-Nielsen, J.; Izarzugaza, J. M.; Brunak, S.; Chakraborty, A.; Basak, J.; Mukhopadhyay, A.; Soibam, B. S.; Das, D.; Biswas, N.; Das, S.; Sarkar, S.; Maitra, A.; Panda, C.; Majumder, P.; Morsy, H.; Gaballah, A.; Samir, M.; Shamseya, M.; Mahrous, H.; Ghazal, A.; Arafat, W.; Hashish, M.; Gruber, J. J.; Jaeger, N.; Snyder, M.; Patel, K.; Bowman, S.; Davis, T.; Kraushaar, D.; Emerman, A.; Russello, S.; Henig, N.; Hendrickson, C.; Zhang, K.; Rodriguez-Dorantes, M.; Cruz-Hernandez, C. D.; Garcia-Tobilla, C. D. P.; Solorzano-Rosales, S.; Jäger, N.; Chen, J.; Haile, R.; Hitchins, M.; Brooks, J. D.; Snyder, M.; Jiménez-Morales, S.; Ramírez, M.; Nuñez, J.; Bekker, V.; Leal, Y.; Jiménez, E.; Medina, A.; Hidalgo, A.; Mejía, J.; Halytskiy, V.; Naggert, J.; Collin, G. B.; DeMauro, K.; Hanusek, R.; Nishina, P. M.; Belhassa, K.; Belhassan, K.; Bouguenouch, L.; Samri, I.; Sayel, H.; moufid, FZ.; El Bouchikhi, I.; Trhanint, S.; Hamdaoui, H.; Elotmani, I.; Khtiri, I.; Kettani, O.; Quibibo, L.; Ahagoud, M.; Abbassi, M.; Ouldim, K.; Marusin, A. V.; Kornetov, A. N.; Swarovskaya, M.; Vagaiceva, K.; Stepanov, V.; De La Paz, E. M. Cutiongco; Sy, R.; Nevado, J.; Reganit, P.; Santos, L.; Magno, J. D.; Punzalan, F. E.; Ona, D.; Llanes, E.; Santos-Cortes, R. L.; Tiongco, R.; Aherrera, J.; Abrahan, L.; Pagauitan-Alan, P.; Morelli, K. H.; Domire, J. S.; Pyne, N.; Harper, S.; Burgess, R.; Zhalbinova, M.; Akilzhanova, A.; Rakhimova, S.; Bekbosynova, M.; Myrzakhmetova, S.; Gari, M. A.; Dallol, A.; Alsehli, H.; Gari, A.; Gari, M.; Abuzenadah, A.; Thomas, M.; Sukhai, M.; Garg, S.; Misyura, M.; Zhang, T.; Schuh, A.; Stockley, T.; Kamel-Reid, S.; Sherry, S.; Xiao, C.; Slotta, D.; Rodarmer, K.; Feolo, M.; Kimelman, M.; Godynskiy, G.; O’Sullivan, C.; Yaschenko, E.; Xiao, C.; Yaschenko, E.; Sherry, S.; Rangel-Escareño, C.; Rueda-Zarate, H.; Tayubi, I. A.; Mohammed, R.; Ahmed, I.; Ahmed, T.; Seth, S.; Amin, S.; Song, X.; Mao, X.; Sun, H.; Verhaak, R. G.; Futreal, A.; Zhang, J.; Whiite, S. J.; Chiang, T.; English, A.; Farek, J.; Kahn, Z.; Salerno, W.; Veeraraghavan, N.; Boerwinkle, E.; Gibbs, R.; Kasukawa, T.; Lizio, M.; Harshbarger, J.; Hisashi, S.; Severin, J.; Imad, A.; Sahin, S.; Freeman, T. C.; Baillie, K.; Sandelin, A.; Carninci, P.; Forrest, A. R. R.; Kawaji, H.; Salerno, W.; English, A.; Shekar, S. N.; Mangubat, A.; Bruestle, J.; Boerwinkle, E.; Gibbs, R. A.; Salem, A. H.; Ali, M.; Ibrahim, A.; Ibrahim, M.; Barrera, H. A.; Garza, L.; Torres, J. A.; Barajas, V.; Ulloa-Aguirre, A.; Kershenobich, D.; Mortaji, Shahroj; Guizar, Pedro; Loera, Eliezer; Moreno, Karen; De León, Adriana; Monsiváis, Daniela; Gómez, Jackeline; Cardiel, Raquel; Fernandez-Lopez, J. C.; Bonifaz-Peña, V.; Rangel-Escareño, C.; Hidalgo-Miranda, A.; Contreras, A. V.; Polfus, L.; Wang, X.; Philip, V.; Carter, G.; Abuzenadah, A. A.; Gari, M.; Turki, R.; Dallol, A.; Uyar, A.; Kaygun, A.; Zaman, S.; Marquez, E.; George, J.; Ucar, D.; Hendrickson, C. L.; Emerman, A.; Kraushaar, D.; Bowman, S.; Henig, N.; Davis, T.; Russello, S.; Patel, K.; Starr, D. B.; Baird, M.; Kirkpatrick, B.; Sheets, K.; Nitsche, R.; Prieto-Lafuente, L.; Landrum, M.; Lee, J.; Rubinstein, W.; Maglott, D.; Thavanati, P. K. R.; de Dios, A. Escoto; Hernandez, R. E. Navarro; Aldrate, M. E. Aguilar; Mejia, M. R. Ruiz; Kanala, K. R. R.; Abduljaleel, Z.; Khan, W.; Al-Allaf, F. A.; Athar, M.; Taher, M. M.; Shahzad, N.; Bouazzaoui, A.; Huber, E.; Dan, A.; Al-Allaf, F. A.; Herr, W.; Sprotte, G.; Köstler, J.; Hiergeist, A.; Gessner, A.; Andreesen, R.; Holler, E.; Al-Allaf, F.; Alashwal, A.; Abduljaleel, Z.; Taher, M.; Bouazzaoui, A.; Abalkhail, H.; Al-Allaf, A.; Bamardadh, R.; Athar, M.; Filiptsova, O.; Kobets, M.; Kobets, Y.; Burlaka, I.; Timoshyna, I.; Filiptsova, O.; Kobets, M. N.; Kobets, Y.; Burlaka, I.; Timoshyna, I.; Filiptsova, O.; Kobets, M. N.; Kobets, Y.; Burlaka, I.; Timoshyna, I.; Al-allaf, F. A.; Mohiuddin, M. T.; Zainularifeen, A.; Mohammed, A.; Abalkhail, H.; Owaidah, T.; Bouazzaoui, A.

doi:10.1186/s40246-016-0063-5

Human Genomics

Table 3 (abstract P46). Genetic differentiation among Native and admixed Mexican populations

From: Human genome meeting 2016

POP1_name	POP2_name	POP1_freq rs776746	POP2_freq rs776746	*Fst* (Pop1vsPop2)
ZAPOTECAS	CEU(hapmap)	0.07143	0.036	0.0062
ZAPOTECAS	YRI(hapmap)	0.07143	0.845	0.6026
ZAPOTECAS	JPT+CHB	0.07143	0.2921	0.0819
ZAPOTECAS	MEXICAN MESTIZOS	0.07143	0.2263	0.0473
ZAPOTECAS	MIXTECOS	0.07143	0.23333	0.0507
ZAPOTECAS	MAYAS	0.07143	0.1481	0.0150
ZAPOTECAS	TEPEHUANES	0.07143	0.4348	0.1746
MAYAS	CEU(hanmap)	0.1481	0.036	0.0376
MAYAS	YRI(hapmap)	0.1481	0.845	0.4857
MAYAS	JPT+CHB	0.1481	0.2921	0.0302
MAYAS	MIXTECOS	0.1481	0.23333	0.01188
MAYAS	TEPEHUANES	0.1481	0.4348	0.0995
MAYAS	MEXICAN MESTIZOS	0.1481	0.2263	0.0100
TEPEHUANES	CEU(hanmap)	0.4348	0.036	0.2209
TEPEHUANES	YRI(hapmap)	0.4348	0.845	0.1826
TEPEHUANES	JPT+CHB	0.4348	0.2921	0.0220
TEPEHUANES	MIXTECOS	0.4348	0.23333	0.0456
TEPEHUANES	MEXICAN MESTIZOS	0.4348	0.2263	0.0456
MIXTECOS	CEU(hanmap)	0.23333	0.036	0.0835
MIXTECOS	YRI(hapmap)	0.23333	0.845	0.3764
MIXTECOS	JPT+CHB	0.23333	0.2921	0.0045
MIXTECOS	MEXICAN MESTIZOS	0.23333	0.2263	0.001
MEXICAN MESTIZOS	CEU(hanmap)	0.2263	0.036	0.0795
MEXICAN MESTIZOS	YRI(hapmap)	0.2263	0.845	0.3847
MEXICAN MESTIZOS	JPT+CHB	0.2263	0.2921	0.0056

Back to article page

ISSN: 1479-7364

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com