Skip to main content

Table 7 The expected accuracy results of the missense mutations of epidermal keratins in mild psoriasis predicted as deleterious in PredictSNP and integrated tool

From: Mutational analysis of epidermal and hyperproliferative type I keratins in mild and moderate psoriasis vulgaris patients: a possible role in the pathogenesis of psoriasis along with disease severity

Gene CDS mutation AA mutation Predict SNP MAPP PhD-SNP PolyPhen-1 PolyPhen-2 SIFT SNAP PANTHER
Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy Prediction Accuracy
K14 c.372C > A p.D124E DEL 0.55 DEL 0.59 DEL 0.68 NEU 0.67 DEL 0.59 DEL 0.53 NEU 0.67 DEL 0.69
c.414G > C p.E138D NEU 0.65 NEU 0.64 DEL 0.59 NEU 0.67 NEU 0.72 DEL 0.43 NEU 0.71 DEL 0.66
c.467C > T p.P156L NEU 0.60 DEL 0.48 NEU 0.66 NEU 0.67 DEL 0.40 DEL 0.53 NEU 0.58 DEL 0.67
c.479A > T p.K160I DEL 0.55 DEL 0.41 NEU 0.66 DEL 0.74 NEU 0.61 DEL 0.45 DEL 0.62 DEL 0.57
c.659G > T p.G220V DEL 0.51 NEU 0.73 NEU 0.45 DEL 0.74 DEL 0.65 DEL 0.79 NEU 0.55 DEL 0.74
c.896G > C p.R299P DEL 0.87 DEL 0.75 DEL 0.88 DEL 0.59 DEL 0.50 DEL 0.53 DEL 0.72 DEL 0.74
c.944G > C p.R315P DEL 0.76 DEL 0.62 DEL 0.82 DEL 0.59 DEL 0.50 DEL 0.79 NEU 0.50 DEL 0.70
c.1237G > A p.A413T NEU 0.65 DEL 0.62 NEU 0.51 NEU 0.67 DEL 0.40 NEU 0.67 NEU 0.71 NEU 0.47
c.1246C > T p.R416C DEL 0.61 DEL 0.57 DEL 0.88 DEL 0.59 DEL 0.50 NEU 0.71 NEU 0.55 DEL 0.78
K10 c.414T > A p.D138E NEU 0.83 NEU 0.77 NEU 0.66 0 0 0 0 NEU 0.81 NEU 0.83 NEU 0.67
c.428C > T p.S143F NEU 0.60 NEU 0.75 DEL 0.61 0 0 0 0 DEL 0.53 NEU 0.55 DEL 0.74
c.502G > C p.E168Q DEL 0.76 DEL 0.59 DEL 0.86 DEL 0.59 DEL 0.63 DEL 0.53 NEU 0.50 DEL 0.74
c.679G > T p.A227S DEL 0.52 DEL 0.41 DEL 0.77 NEU 0.67 DEL 0.50 DEL 0.46 NEU 0.71 DEL 0.57
c.715G > C p.E239Q DEL 0.76 DEL 0.48 DEL 0.68 DEL 0.59 DEL 0.63 DEL 0.79 NEU 0.55 DEL 0.74
c.730C > G p.L244V DEL 0.55 DEL 0.59 DEL 0.68 NEU 0.67 DEL 0.50 DEL 0.53 NEU 0.71 DEL 0.66
c.770G > T p.R257M DEL 0.76 DEL 0.51 DEL 0.73 DEL 0.74 DEL 0.54 DEL 0.79 NEU 0.58 DEL 0.74
  1. DEL deleterious, NEU neutral